Microarrays en Cáncer Pulmonar

En cáncer de pulmón es útil para detección y diagnóstico de genes que se activan o se reprimen en distintas condiciones, así como para la detección de las amplificaciones y deleciones de ADN que contribuyen al desarrollo y progresión de cáncer. En el CPCNP, gracias a esta tecnología, se han identificado como importantes en el desarrollo y progresión a los genes EGFR, HER2, p53, RRM1 y ERCC1; el análisis de estos genes en los pacientes con este cáncer puede predecir su supervivencia, y su utilidad está considerada en la respuesta al tratamiento. En el CPCP ayuda a identificar alteraciones novedosas y es capaz de establecer hibridación genómica comparativa 

Referencia

http://www.scielo.org.pe/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1726-46342013000100017

https://revistageneticamedica.com/wp-content/uploads/2018/04/GMG02-web-25042018b.pdf#page=33

PCR en Cáncer Pulmonar

El Idylla ™ EGFR Mutation Test es una prueba para detectar EGFR mutaciones en el cáncer de pulmón, que cubre todas las mutaciones clínicamente relevantes en los exones 18 a 21. La prueba es un cartucho desechable de un solo uso que puede realizar una PCR automatizada en una sola sección de tejido incluido en parafina (FFPE) fijado con formalina que contiene tan solo un 10% de células tumorales. Esto requiere una habilidad y un equipo mínimos y puede lograr un resultado bajo demanda dentro de las tres horas posteriores al momento en que el patólogo solicita la prueba.

MUESTRA	Pequeñas biopsias de pulmón de adenocarcinoma de pulmón
AN	ADN tumoral
GEN AMPLIFICADO	Gen EGFR
PCR	PCR en tiempo real
VISUALIZACIÓN	Fluorescencia

Etapa	Paso	Temperatura (°C)	Tiempo (h:min:s)	Número de ciclos
1	1	50	0:02:00	1
2	1	95	0:10:00	1
3	1	95	0:00:15	45
	2	60	0:01:00

Referencia
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6349793/ 
http://www2.inecc.gob.mx/publicaciones2/libros/710/pcrtiempo.pdf

Tamizaje y Métodos de Confirmación del Cancer Pulmonar

Actualmente no existe una prueba de tamizaje para el cáncer pulmonar, desde el 2006 gracias al proyecto Atlas del Genoma del Cáncer se sabe que existen 18 genes mutados de manera importante y alrededor de 1300 proteínas alteradas en el cáncer pulmonar, se han realizado Ensayos aleatorios de tomografía computarizada de baja dosis comparada con radiografía de tórax, tal es el caso de la prueba nacional de detección de pulmón o el estudio de detección de pulmón realizados en Estados Unidos sin resultados concluyentes, hoy en día se apuesta por  marcadores tumorales genéticos o proteínicos en el que según el instituto nacional del cáncer hay fondos invertidos para el descubrimiento de métodos moleculares que permitan la predicción y posterior tratamiento del mismo. Eemplos:

• Enolasa neuronal específica (NSE)
• Fragmentos de citoqueratina 21-1

En cuanto a los métodos de confirmación existen:

Estudios de imágenes

• radiografía de torax
• tomografia computarizada
• resonancia magnética
• tomografía por esmision de positrones
• ganmagrafía ósea

Pruebas diagnósticas

• citología de esputo
• toracosentesis
• biopsia con aguja
• broncoscopía
• estudios de inmunohistoquímica
• pruebas moleculares
  

Referencias
https://www.cancer.org/es/cancer/cancer-de-pulmon-no-microcitico/deteccion-diagnostico-clasificacion-por-etapas/como-se-diagnostica.html
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK154614/
https://www.cancer.gov/espanol/cancer/diagnostico-estadificacion/diagnostico/hoja-informativa-marcadores-de-tumores
https://portal.gdc.cancer.gov/exploration?filters=%7B%22op%22%3A%22and%22%2C%22content%22%3A%5B%7B%22op%22%3A%22in%22%2C%22content%22%3A%7B%22field%22%3A%22cases.primary_site%22%2C%22value%22%3A%5B%22Bronchus%20and%20lung%22%5D%7D%7D%5D%7D&genesTable_offset=10&searchTableTab=genes

Alteraciones Epigenéticas en el Cáncer Pulmonar

El cáncer pulmonar las alteraciones epigenéticas son más frecuentes que las mutaciones somáticas.
Los mecanismos epigenéticos involucran la metilación del ADN, las modificaciones covalentes de las histonas (acetilación, metilación, fosforilación, entre otras) y la presencia de ARN no codificantes.
Resultan en la desregulación de oncogenes, genes supresores de tumores y genes involucrados con los sistemas de reparación del ADN.

Referencias
https://revistageneticamedica.com/wp-content/uploads/2018/04/GMG02-web-25042018b.pdf#page=33
https://www.elsevier.es/es-revista-gaceta-mexicana-oncologia-305-articulo-las-alteraciones-epigeneticas-progresion-del-X1665920114579068