En cáncer de pulmón es útil para detección y diagnóstico de genes que se activan o se reprimen en distintas condiciones, así como para la detección de las amplificaciones y deleciones de ADN que contribuyen al desarrollo y progresión de cáncer. En el CPCNP, gracias a esta tecnología, se han identificado como importantes en el desarrollo y progresión a los genes EGFR, HER2, p53, RRM1 y ERCC1; el análisis de estos genes en los pacientes con este cáncer puede predecir su supervivencia, y su utilidad está considerada en la respuesta al tratamiento. En el CPCP ayuda a identificar alteraciones novedosas y es capaz de establecer hibridación genómica comparativa
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